Distinct patterns of somatic genome alterations in lung adenocarcinomas and squamous cell carcinomas JD Campbell, A Alexandrov, J Kim, J Wala, AH Berger, CS Pedamallu, ... Nature genetics 48 (6), 607-616, 2016 | 1166 | 2016 |
Assemblathon 2: evaluating de novo methods of genome assembly in three vertebrate species KR Bradnam, JN Fass, A Alexandrov, P Baranay, M Bechner, I Birol, ... Gigascience 2 (1), 2047-217X-2-10, 2013 | 808 | 2013 |
Endogenous neoantigen-specific CD8 T cells identified in two glioblastoma models using a cancer immunogenomics approach TM Johanns, JP Ward, CA Miller, C Wilson, DK Kobayashi, D Bender, ... Cancer immunology research 4 (12), 1007-1015, 2016 | 92 | 2016 |
Targeted next-generation sequencing (NGS) of nine candidate genes with custom AmpliSeq in patients and a cardiomyopathy risk group AS Glotov, SV Kazakov, EA Zhukova, AV Alexandrov, OS Glotov, ... Clinica Chimica Acta 446, 132-140, 2015 | 49 | 2015 |
Cancer immunogenomic approach to neoantigen discovery in a checkpoint blockade responsive murine model of oral cavity squamous cell carcinoma P Zolkind, D Przybylski, N Marjanovic, L Nguyen, T Lin, T Johanns, ... Oncotarget 9 (3), 4109, 2018 | 35 | 2018 |
Endogenous neoantigen-specific CD8 T cells identified in two glioblastoma models using a cancer immunogenomics approach. Cancer Immunol Res. 2016; 4: 1007–1015. doi: 10.1158 … TM Johanns, JP Ward, CA Miller, C Wilson, DK Kobayashi, D Bender, ... CIR-16-0156, 0 | 23 | |
Cancer Genome Atlas Research N, Artyomov MN, Schreiber R, Govindan R, Meyerson M. Distinct patterns of somatic genome alterations in lung adenocarcinomas and squamous cell … JD Campbell, A Alexandrov, J Kim, J Wala, AH Berger, CS Pedamallu, ... Nat Genet 48 (6), 607-16, 2016 | 21 | 2016 |
Совместное применение графа де Брёйна, графа перекрытий и микросборки для de novo сборки генома АА Сергушичев, АВ Александров, СВ Казаков, ФН Царев, АА Шалыто Известия Саратовского университета. Новая серия. Серия Математика. Механика …, 2013 | 11 | 2013 |
Метод сборки контигов геномных последовательностей на основе совместного применения графов де Брюина и графов перекрытий АВ Александров, СВ Казаков, СВ Мельников, АА Сергушичев, ... gas, 1605-1608, 2012 | 11 | 2012 |
Genetic algorithm for induction of finite automata with continuous and discrete output actions A Alexandrov, A Sergushichev, S Kazakov, F Tsarev Proceedings of the 13th annual conference companion on Genetic and …, 2011 | 11 | 2011 |
Assemblathon 2: Evaluating de novo methods of genome assembly in three vertebrate species. GigaScience. 2013; 2 (1): 10 K Bradnam, J Fass, A Alexandrov, P Baranay, M Bechner, I Birol | 10 | 2017 |
The use of evolutionary programming based on training examples for the generation of finite state machines for controlling objects with complex behavior AV Aleksandrov, SV Kazakov, AA Sergushichev, FN Tsarev, AA Shalyto Journal of Computer and Systems Sciences International 52, 410-425, 2013 | 9 | 2013 |
Метод исправления ошибок в наборе чтений нуклеотидной последовательности АВ Александров, СВ Казаков, СВ Мельников, АА Сергушичев, ... Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики, 81-84, 2011 | 8 | 2011 |
Генерация конечных автоматов для управления моделью беспилотного самолета АВ Александров, СВ Казаков, АА Сергушичев, ФН Царев, АА Шалыто Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики, 3-11, 2011 | 7 | 2011 |
Применение генетического программирования на основе обучающих примеров для генерации конечных автоматов, управляющих объектами со сложным поведением КСВ Александров AВ, АА Сергушичев, ФН Царев, АА Шалыто Научно-технический вестник СПбГУ ИТМО, 3-11, 2011 | 6 | 2011 |
Применение эволюционного программирования на основе обучающих примеров для генерации конечных автоматов, управляющих объектами со сложным поведением АВ Александров, СВ Казаков, АА Сергушичев, ФН Царев, АА Шалыто Известия Российской академии наук. Теория и системы управления, 85-85, 2013 | 5 | 2013 |
Combining de Bruijn graph, overlaps graph and microassembly for de novo genome assembly A Alexandrov, S Kazakov, S Melnikov, A Sergushichev, A Shalyto, ... Proceedings of Bioinformatics, 2012 | 5 | 2012 |
Errors correction method in the readings set of nucleotide sequence AV Alexandrov, S Kazakov, S Melnikov, AA Sergushichev, F Tsarev, ... Nauchno-Tekhnicheskii Vestnik Informatsionnykh Tekhnologii, Mekhaniki i …, 2011 | 5 | 2011 |
143; Identification of Neoantigen-specific CD8+ T Cells in Two Murine Orthotopic Glioblastoma Models Using Cancer Immunogenomics TM Johanns, J Ward, C Wilson, DK Kobayashi, D Bender, Y Fu, ... Neurosurgery 63, 158, 2016 | 3 | 2016 |
Combining de Bruijn graphs, overlap graphs and microassembly for de novo genome assembly AA Sergushichev, AV Alexandrov, SV Kazakov, FN Tsarev, AA Shalyto Izv. Saratov Univ.(NS), Ser. Math. Mech. Inform 13 (2), 51-57, 2013 | 3 | 2013 |